Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cd28P31041 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cd28P31041 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cd28P31041 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cd28P31041 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cd28P31041 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cd28P31041 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cd28P31041 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Cd28P31041 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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