Protein–RNA interactions for Protein: P28738

Kif5c, Kinesin heavy chain isoform 5C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif5cP28738 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kif5cP28738 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kif5cP28738 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kif5cP28738 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Kif5cP28738 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kif5cP28738 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kif5cP28738 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kif5cP28738 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kif5cP28738 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kif5cP28738 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kif5cP28738 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kif5cP28738 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kif5cP28738 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kif5cP28738 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kif5cP28738 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Kif5cP28738 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kif5cP28738 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kif5cP28738 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kif5cP28738 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kif5cP28738 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kif5cP28738 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kif5cP28738 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kif5cP28738 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kif5cP28738 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kif5cP28738 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kif5cP28738 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kif5cP28738 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kif5cP28738 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kif5cP28738 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kif5cP28738 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kif5cP28738 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kif5cP28738 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kif5cP28738 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Kif5cP28738 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Kif5cP28738 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Kif5cP28738 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Kif5cP28738 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Kif5cP28738 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Kif5cP28738 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Kif5cP28738 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Kif5cP28738 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Kif5cP28738 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Kif5cP28738 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Kif5cP28738 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kif5cP28738 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kif5cP28738 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kif5cP28738 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kif5cP28738 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kif5cP28738 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kif5cP28738 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kif5cP28738 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kif5cP28738 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kif5cP28738 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Kif5cP28738 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Kif5cP28738 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kif5cP28738 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Kif5cP28738 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Kif5cP28738 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Kif5cP28738 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kif5cP28738 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Kif5cP28738 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Kif5cP28738 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kif5cP28738 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kif5cP28738 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kif5cP28738 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kif5cP28738 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kif5cP28738 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kif5cP28738 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kif5cP28738 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kif5cP28738 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kif5cP28738 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kif5cP28738 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kif5cP28738 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kif5cP28738 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kif5cP28738 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kif5cP28738 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kif5cP28738 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kif5cP28738 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kif5cP28738 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kif5cP28738 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kif5cP28738 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kif5cP28738 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kif5cP28738 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kif5cP28738 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kif5cP28738 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kif5cP28738 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kif5cP28738 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kif5cP28738 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kif5cP28738 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kif5cP28738 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kif5cP28738 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Kif5cP28738 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kif5cP28738 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kif5cP28738 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kif5cP28738 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kif5cP28738 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kif5cP28738 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Kif5cP28738 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Kif5cP28738 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kif5cP28738 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms