Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RxrgP28705 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RxrgP28705 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RxrgP28705 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RxrgP28705 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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RxrgP28705 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RxrgP28705 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RxrgP28705 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RxrgP28705 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RxrgP28705 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RxrgP28705 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
RxrgP28705 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RxrgP28705 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RxrgP28705 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RxrgP28705 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RxrgP28705 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RxrgP28705 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RxrgP28705 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RxrgP28705 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RxrgP28705 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RxrgP28705 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RxrgP28705 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RxrgP28705 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RxrgP28705 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RxrgP28705 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RxrgP28705 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RxrgP28705 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RxrgP28705 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RxrgP28705 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RxrgP28705 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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