Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Hoxd10P28359 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Hoxd10P28359 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Hoxd10P28359 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Hoxd10P28359 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
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