Protein–RNA interactions for Protein: P28309

Defa2, Alpha-defensin 2, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa2P28309 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa2P28309 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa2P28309 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa2P28309 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa2P28309 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa2P28309 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa2P28309 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa2P28309 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa2P28309 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa2P28309 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa2P28309 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa2P28309 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa2P28309 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa2P28309 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa2P28309 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa2P28309 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa2P28309 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa2P28309 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa2P28309 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa2P28309 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa2P28309 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa2P28309 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa2P28309 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa2P28309 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa2P28309 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa2P28309 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa2P28309 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa2P28309 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms