Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms