Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.9 ms