Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd12P23812 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd12P23812 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd12P23812 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd12P23812 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd12P23812 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd12P23812 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd12P23812 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd12P23812 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd12P23812 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd12P23812 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd12P23812 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd12P23812 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd12P23812 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd12P23812 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd12P23812 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd12P23812 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd12P23812 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd12P23812 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd12P23812 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd12P23812 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd12P23812 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd12P23812 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd12P23812 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxd12P23812 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxd12P23812 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxd12P23812 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxd12P23812 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxd12P23812 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxd12P23812 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxd12P23812 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxd12P23812 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxd12P23812 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxd12P23812 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxd12P23812 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxd12P23812 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxd12P23812 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxd12P23812 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxd12P23812 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxd12P23812 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxd12P23812 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxd12P23812 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxd12P23812 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxd12P23812 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxd12P23812 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxd12P23812 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxd12P23812 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxd12P23812 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxd12P23812 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxd12P23812 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxd12P23812 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms