Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd8P23463 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms