Protein–RNA interactions for Protein: P21952

Pou3f1, POU domain, class 3, transcription factor 1, mousemouse

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f1P21952 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pou3f1P21952 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Pou3f1P21952 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pou3f1P21952 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pou3f1P21952 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pou3f1P21952 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pou3f1P21952 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pou3f1P21952 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pou3f1P21952 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pou3f1P21952 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pou3f1P21952 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pou3f1P21952 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pou3f1P21952 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pou3f1P21952 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pou3f1P21952 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pou3f1P21952 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pou3f1P21952 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pou3f1P21952 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pou3f1P21952 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pou3f1P21952 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pou3f1P21952 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pou3f1P21952 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pou3f1P21952 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pou3f1P21952 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pou3f1P21952 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Pou3f1P21952 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pou3f1P21952 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pou3f1P21952 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pou3f1P21952 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pou3f1P21952 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Pou3f1P21952 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Pou3f1P21952 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Pou3f1P21952 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pou3f1P21952 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pou3f1P21952 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pou3f1P21952 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pou3f1P21952 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pou3f1P21952 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pou3f1P21952 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pou3f1P21952 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pou3f1P21952 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pou3f1P21952 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pou3f1P21952 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pou3f1P21952 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pou3f1P21952 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pou3f1P21952 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pou3f1P21952 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pou3f1P21952 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pou3f1P21952 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pou3f1P21952 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pou3f1P21952 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Pou3f1P21952 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pou3f1P21952 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pou3f1P21952 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pou3f1P21952 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pou3f1P21952 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pou3f1P21952 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pou3f1P21952 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pou3f1P21952 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pou3f1P21952 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pou3f1P21952 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pou3f1P21952 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pou3f1P21952 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pou3f1P21952 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pou3f1P21952 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Pou3f1P21952 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pou3f1P21952 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pou3f1P21952 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pou3f1P21952 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pou3f1P21952 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pou3f1P21952 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pou3f1P21952 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pou3f1P21952 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pou3f1P21952 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pou3f1P21952 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pou3f1P21952 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pou3f1P21952 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pou3f1P21952 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pou3f1P21952 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pou3f1P21952 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pou3f1P21952 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pou3f1P21952 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pou3f1P21952 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pou3f1P21952 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pou3f1P21952 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pou3f1P21952 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pou3f1P21952 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pou3f1P21952 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pou3f1P21952 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pou3f1P21952 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pou3f1P21952 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pou3f1P21952 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Pou3f1P21952 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pou3f1P21952 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pou3f1P21952 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Pou3f1P21952 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pou3f1P21952 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pou3f1P21952 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pou3f1P21952 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pou3f1P21952 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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