Protein–RNA interactions for Protein: P21619

Lmnb2, Lamin-B2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb2P21619 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmnb2P21619 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmnb2P21619 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmnb2P21619 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmnb2P21619 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmnb2P21619 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmnb2P21619 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmnb2P21619 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmnb2P21619 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmnb2P21619 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmnb2P21619 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmnb2P21619 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmnb2P21619 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmnb2P21619 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmnb2P21619 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmnb2P21619 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmnb2P21619 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmnb2P21619 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmnb2P21619 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmnb2P21619 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmnb2P21619 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmnb2P21619 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmnb2P21619 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmnb2P21619 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmnb2P21619 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmnb2P21619 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmnb2P21619 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmnb2P21619 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmnb2P21619 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmnb2P21619 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmnb2P21619 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmnb2P21619 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmnb2P21619 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmnb2P21619 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmnb2P21619 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmnb2P21619 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmnb2P21619 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmnb2P21619 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmnb2P21619 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmnb2P21619 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmnb2P21619 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmnb2P21619 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmnb2P21619 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmnb2P21619 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmnb2P21619 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmnb2P21619 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmnb2P21619 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmnb2P21619 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmnb2P21619 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmnb2P21619 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmnb2P21619 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmnb2P21619 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmnb2P21619 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmnb2P21619 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmnb2P21619 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmnb2P21619 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmnb2P21619 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmnb2P21619 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmnb2P21619 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmnb2P21619 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmnb2P21619 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmnb2P21619 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmnb2P21619 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmnb2P21619 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmnb2P21619 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmnb2P21619 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmnb2P21619 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmnb2P21619 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmnb2P21619 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmnb2P21619 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmnb2P21619 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmnb2P21619 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmnb2P21619 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmnb2P21619 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmnb2P21619 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmnb2P21619 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmnb2P21619 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmnb2P21619 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmnb2P21619 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmnb2P21619 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmnb2P21619 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmnb2P21619 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lmnb2P21619 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lmnb2P21619 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lmnb2P21619 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmnb2P21619 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmnb2P21619 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmnb2P21619 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmnb2P21619 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmnb2P21619 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmnb2P21619 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmnb2P21619 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmnb2P21619 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmnb2P21619 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmnb2P21619 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmnb2P21619 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmnb2P21619 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmnb2P21619 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmnb2P21619 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmnb2P21619 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms