Protein–RNA interactions for Protein: P21275

Bmp4, Bone morphogenetic protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bmp4P21275 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bmp4P21275 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bmp4P21275 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bmp4P21275 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bmp4P21275 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bmp4P21275 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bmp4P21275 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bmp4P21275 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bmp4P21275 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bmp4P21275 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bmp4P21275 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bmp4P21275 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bmp4P21275 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bmp4P21275 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bmp4P21275 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bmp4P21275 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bmp4P21275 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bmp4P21275 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bmp4P21275 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Bmp4P21275 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bmp4P21275 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bmp4P21275 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bmp4P21275 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Bmp4P21275 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bmp4P21275 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bmp4P21275 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bmp4P21275 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bmp4P21275 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bmp4P21275 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bmp4P21275 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bmp4P21275 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bmp4P21275 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bmp4P21275 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bmp4P21275 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Bmp4P21275 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bmp4P21275 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bmp4P21275 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bmp4P21275 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bmp4P21275 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bmp4P21275 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bmp4P21275 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bmp4P21275 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bmp4P21275 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bmp4P21275 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bmp4P21275 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bmp4P21275 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bmp4P21275 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bmp4P21275 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Bmp4P21275 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bmp4P21275 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bmp4P21275 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bmp4P21275 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bmp4P21275 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bmp4P21275 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bmp4P21275 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bmp4P21275 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bmp4P21275 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bmp4P21275 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bmp4P21275 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bmp4P21275 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bmp4P21275 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bmp4P21275 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bmp4P21275 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bmp4P21275 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bmp4P21275 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bmp4P21275 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bmp4P21275 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bmp4P21275 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bmp4P21275 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bmp4P21275 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bmp4P21275 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bmp4P21275 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bmp4P21275 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bmp4P21275 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bmp4P21275 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bmp4P21275 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bmp4P21275 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bmp4P21275 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bmp4P21275 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bmp4P21275 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bmp4P21275 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bmp4P21275 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bmp4P21275 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bmp4P21275 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Bmp4P21275 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bmp4P21275 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Bmp4P21275 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bmp4P21275 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bmp4P21275 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bmp4P21275 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bmp4P21275 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bmp4P21275 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bmp4P21275 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bmp4P21275 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bmp4P21275 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bmp4P21275 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bmp4P21275 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bmp4P21275 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bmp4P21275 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bmp4P21275 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms