Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
P20040 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
P20040 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
P20040 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
P20040 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
P20040 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
P20040 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
P20040 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
P20040 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
P20040 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
P20040 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
P20040 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
P20040 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
P20040 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
P20040 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
P20040 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
P20040 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P20040 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
P20040 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P20040 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
P20040 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P20040 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
P20040 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P20040 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
P20040 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P20040 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
P20040 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P20040 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P20040 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P20040 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P20040 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P20040 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P20040 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P20040 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
P20040 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P20040 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P20040 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
P20040 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
P20040 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
P20040 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
P20040 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
P20040 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P20040 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P20040 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P20040 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P20040 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
P20040 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
P20040 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P20040 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
P20040 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P20040 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P20040 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P20040 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P20040 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
P20040 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
P20040 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
P20040 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
P20040 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
P20040 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
P20040 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
P20040 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
P20040 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
P20040 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
P20040 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
P20040 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
P20040 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
P20040 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
P20040 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
P20040 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
P20040 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
P20040 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
P20040 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
P20040 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
P20040 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
P20040 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
P20040 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
P20040 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
P20040 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
P20040 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
P20040 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
P20040 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
P20040 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
P20040 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
P20040 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
P20040 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
P20040 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
P20040 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
P20040 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
P20040 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
P20040 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
P20040 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
P20040 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
P20040 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
P20040 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
P20040 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
P20040 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
P20040 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
P20040 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
P20040 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
P20040 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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