Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms