Protein–RNA interactions for Protein: P19001

Krt19, Keratin, type I cytoskeletal 19, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt19P19001 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt19P19001 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt19P19001 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt19P19001 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt19P19001 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt19P19001 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt19P19001 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt19P19001 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt19P19001 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt19P19001 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt19P19001 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt19P19001 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt19P19001 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt19P19001 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt19P19001 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt19P19001 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt19P19001 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt19P19001 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt19P19001 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt19P19001 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt19P19001 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt19P19001 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt19P19001 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt19P19001 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt19P19001 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt19P19001 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt19P19001 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt19P19001 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt19P19001 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt19P19001 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt19P19001 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt19P19001 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt19P19001 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt19P19001 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt19P19001 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt19P19001 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt19P19001 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt19P19001 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt19P19001 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt19P19001 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt19P19001 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt19P19001 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt19P19001 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt19P19001 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt19P19001 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt19P19001 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt19P19001 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt19P19001 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt19P19001 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt19P19001 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt19P19001 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt19P19001 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt19P19001 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt19P19001 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt19P19001 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt19P19001 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt19P19001 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt19P19001 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt19P19001 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt19P19001 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt19P19001 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt19P19001 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt19P19001 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt19P19001 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt19P19001 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt19P19001 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt19P19001 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt19P19001 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt19P19001 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt19P19001 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt19P19001 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt19P19001 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt19P19001 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt19P19001 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt19P19001 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt19P19001 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt19P19001 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt19P19001 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt19P19001 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt19P19001 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt19P19001 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt19P19001 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt19P19001 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt19P19001 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt19P19001 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt19P19001 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt19P19001 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt19P19001 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt19P19001 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt19P19001 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt19P19001 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt19P19001 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt19P19001 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt19P19001 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt19P19001 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt19P19001 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt19P19001 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt19P19001 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt19P19001 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt19P19001 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms