Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps6ka1P18653 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms