Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms