Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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