Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms