Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms