Protein–RNA interactions for Protein: P12657

Chrm1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrm1P12657 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Gm12001-201ENSMUST00000121727 913 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Gm16337-201ENSMUST00000160368 917 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 2810404M03Rik-201ENSMUST00000188324 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Gm37228-201ENSMUST00000193574 331 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Gm44554-201ENSMUST00000208738 147 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Gm45276-201ENSMUST00000209549 1086 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Gm36278-201ENSMUST00000217030 918 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Ift43-201ENSMUST00000054565 773 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 mt-Nd2-201ENSMUST00000082396 1038 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Gm17983-201ENSMUST00000190766 594 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 CT572999.1-201ENSMUST00000220315 1260 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Vmn1r3-201ENSMUST00000105159 1011 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Gm15061-201ENSMUST00000121076 1046 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms