Protein–RNA interactions for Protein: P11369

Pol, LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP11369 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PolP11369 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PolP11369 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PolP11369 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PolP11369 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PolP11369 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PolP11369 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PolP11369 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PolP11369 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PolP11369 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PolP11369 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PolP11369 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PolP11369 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PolP11369 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PolP11369 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PolP11369 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PolP11369 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PolP11369 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PolP11369 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PolP11369 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PolP11369 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PolP11369 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PolP11369 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PolP11369 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PolP11369 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PolP11369 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PolP11369 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PolP11369 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PolP11369 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PolP11369 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PolP11369 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PolP11369 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PolP11369 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PolP11369 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PolP11369 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PolP11369 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PolP11369 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PolP11369 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PolP11369 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PolP11369 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PolP11369 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PolP11369 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PolP11369 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PolP11369 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PolP11369 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PolP11369 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PolP11369 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PolP11369 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PolP11369 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PolP11369 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PolP11369 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PolP11369 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PolP11369 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PolP11369 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PolP11369 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PolP11369 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PolP11369 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PolP11369 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PolP11369 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PolP11369 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PolP11369 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PolP11369 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PolP11369 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
PolP11369 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
PolP11369 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PolP11369 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PolP11369 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PolP11369 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PolP11369 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PolP11369 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PolP11369 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PolP11369 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PolP11369 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PolP11369 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PolP11369 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PolP11369 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PolP11369 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PolP11369 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PolP11369 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PolP11369 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PolP11369 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PolP11369 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PolP11369 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PolP11369 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PolP11369 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PolP11369 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PolP11369 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PolP11369 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PolP11369 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PolP11369 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PolP11369 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PolP11369 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PolP11369 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PolP11369 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PolP11369 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PolP11369 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PolP11369 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PolP11369 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PolP11369 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PolP11369 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms