Protein–RNA interactions for Protein: P10820

Prf1, Perforin-1, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prf1P10820 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prf1P10820 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Prf1P10820 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prf1P10820 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prf1P10820 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prf1P10820 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms