Protein–RNA interactions for Protein: P09027

Hoxd3, Homeobox protein Hox-D3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd3P09027 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 AC124408.1-201ENSMUST00000228938 707 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Gm10271-201ENSMUST00000092165 156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd3P09027 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms