Protein–RNA interactions for Protein: P08122

Col4a2, Collagen alpha-2(IV) chain, mousemouse

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Length 1,707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a2P08122 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Col4a2P08122 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Col4a2P08122 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Col4a2P08122 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Col4a2P08122 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Col4a2P08122 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Col4a2P08122 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Col4a2P08122 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Col4a2P08122 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Col4a2P08122 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Col4a2P08122 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Col4a2P08122 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Col4a2P08122 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Col4a2P08122 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Col4a2P08122 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Col4a2P08122 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Col4a2P08122 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Col4a2P08122 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Col4a2P08122 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Col4a2P08122 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Col4a2P08122 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Col4a2P08122 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Col4a2P08122 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Col4a2P08122 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Col4a2P08122 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Col4a2P08122 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Col4a2P08122 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Col4a2P08122 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Col4a2P08122 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Col4a2P08122 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Col4a2P08122 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Col4a2P08122 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Col4a2P08122 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Col4a2P08122 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Col4a2P08122 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Col4a2P08122 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Col4a2P08122 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Col4a2P08122 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Col4a2P08122 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Col4a2P08122 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Col4a2P08122 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Col4a2P08122 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Col4a2P08122 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Col4a2P08122 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Col4a2P08122 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Col4a2P08122 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Col4a2P08122 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Col4a2P08122 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Col4a2P08122 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Col4a2P08122 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Col4a2P08122 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Col4a2P08122 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Col4a2P08122 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Col4a2P08122 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Col4a2P08122 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col4a2P08122 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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