Protein–RNA interactions for Protein: P08042

Zfp1, Zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp1P08042 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp1P08042 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp1P08042 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp1P08042 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp1P08042 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp1P08042 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp1P08042 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp1P08042 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp1P08042 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp1P08042 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp1P08042 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp1P08042 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp1P08042 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp1P08042 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp1P08042 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp1P08042 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp1P08042 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp1P08042 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp1P08042 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp1P08042 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp1P08042 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp1P08042 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp1P08042 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp1P08042 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp1P08042 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp1P08042 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp1P08042 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp1P08042 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp1P08042 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp1P08042 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp1P08042 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp1P08042 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp1P08042 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp1P08042 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp1P08042 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp1P08042 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp1P08042 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp1P08042 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp1P08042 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp1P08042 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp1P08042 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp1P08042 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp1P08042 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp1P08042 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp1P08042 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp1P08042 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp1P08042 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp1P08042 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp1P08042 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp1P08042 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp1P08042 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zfp1P08042 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zfp1P08042 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zfp1P08042 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zfp1P08042 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zfp1P08042 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Zfp1P08042 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Zfp1P08042 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zfp1P08042 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zfp1P08042 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp1P08042 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Zfp1P08042 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp1P08042 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Zfp1P08042 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp1P08042 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp1P08042 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Zfp1P08042 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Zfp1P08042 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp1P08042 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Zfp1P08042 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Zfp1P08042 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp1P08042 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp1P08042 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp1P08042 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp1P08042 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp1P08042 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp1P08042 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp1P08042 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp1P08042 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp1P08042 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp1P08042 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp1P08042 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp1P08042 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp1P08042 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp1P08042 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp1P08042 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp1P08042 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp1P08042 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp1P08042 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp1P08042 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Zfp1P08042 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp1P08042 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp1P08042 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp1P08042 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp1P08042 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp1P08042 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp1P08042 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp1P08042 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp1P08042 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp1P08042 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms