Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Spta1P08032 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Spta1P08032 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Spta1P08032 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Spta1P08032 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Spta1P08032 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Spta1P08032 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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