Protein–RNA interactions for Protein: P05622

Pdgfrb, Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrbP05622 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms