Protein–RNA interactions for Protein: P01820

Ig heavy chain V region PJ14, mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01820 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01820 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01820 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01820 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01820 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01820 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01820 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01820 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01820 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01820 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01820 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01820 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01820 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01820 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01820 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01820 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01820 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P01820 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01820 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P01820 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01820 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P01820 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P01820 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01820 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P01820 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01820 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01820 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01820 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P01820 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01820 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01820 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01820 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01820 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P01820 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01820 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01820 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01820 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.55
P01820 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P01820 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P01820 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P01820 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
P01820 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01820 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01820 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01820 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01820 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01820 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01820 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01820 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01820 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01820 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01820 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01820 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01820 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01820 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01820 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01820 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01820 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01820 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01820 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01820 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01820 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01820 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01820 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01820 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01820 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01820 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01820 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01820 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01820 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01820 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01820 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01820 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01820 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01820 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01820 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01820 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01820 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01820 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01820 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01820 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01820 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01820 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01820 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01820 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01820 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01820 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01820 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01820 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01820 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01820 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01820 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01820 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01820 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01820 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01820 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01820 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01820 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01820 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01820 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms