Protein–RNA interactions for Protein: P01679

Ig kappa chain V-VI region J539, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01679 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01679 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01679 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01679 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01679 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01679 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01679 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01679 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01679 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01679 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01679 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01679 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01679 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
P01679 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01679 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01679 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01679 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
P01679 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
P01679 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01679 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01679 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
P01679 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
P01679 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01679 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01679 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01679 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01679 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01679 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01679 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01679 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01679 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01679 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01679 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01679 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01679 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
P01679 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01679 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01679 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01679 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01679 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
P01679 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01679 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01679 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01679 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01679 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01679 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01679 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01679 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01679 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01679 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01679 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01679 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01679 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
P01679 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
P01679 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01679 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01679 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01679 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01679 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
P01679 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01679 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
P01679 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01679 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01679 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01679 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01679 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01679 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01679 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01679 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01679 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01679 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01679 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
P01679 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01679 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01679 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
P01679 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01679 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01679 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01679 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01679 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01679 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01679 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
P01679 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01679 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01679 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01679 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01679 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01679 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01679 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01679 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01679 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01679 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
P01679 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01679 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01679 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01679 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01679 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
P01679 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01679 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
P01679 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms