Protein–RNA interactions for Protein: P01647

Ig kappa chain V-V region HP 124E1, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01647 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01647 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01647 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
P01647 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
P01647 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01647 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
P01647 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
P01647 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
P01647 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01647 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
P01647 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
P01647 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01647 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01647 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01647 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01647 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01647 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01647 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01647 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01647 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01647 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01647 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01647 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01647 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01647 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01647 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
P01647 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01647 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01647 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01647 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01647 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01647 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
P01647 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
P01647 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01647 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01647 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
P01647 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01647 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01647 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01647 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01647 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01647 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01647 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01647 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01647 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01647 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01647 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01647 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01647 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01647 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01647 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01647 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01647 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01647 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01647 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01647 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01647 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01647 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01647 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01647 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01647 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01647 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01647 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01647 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01647 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01647 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01647 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01647 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01647 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01647 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01647 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01647 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01647 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01647 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01647 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01647 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01647 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01647 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01647 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01647 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01647 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01647 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01647 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01647 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01647 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01647 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01647 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01647 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01647 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01647 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
P01647 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01647 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01647 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01647 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01647 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01647 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01647 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01647 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01647 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01647 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms