Protein–RNA interactions for Protein: P01644

Ig kappa chain V-V region HP R16.7, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01644 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01644 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
P01644 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01644 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01644 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01644 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01644 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01644 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01644 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01644 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01644 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01644 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01644 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01644 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01644 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01644 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01644 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
P01644 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01644 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01644 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01644 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01644 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01644 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01644 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
P01644 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
P01644 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01644 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01644 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
P01644 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01644 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01644 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01644 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01644 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01644 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01644 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01644 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01644 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01644 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01644 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01644 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01644 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01644 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01644 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01644 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01644 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01644 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01644 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01644 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01644 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01644 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01644 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01644 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01644 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01644 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01644 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01644 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01644 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01644 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01644 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01644 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01644 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01644 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01644 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01644 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01644 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01644 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01644 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01644 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01644 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01644 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01644 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01644 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01644 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01644 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01644 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01644 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01644 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01644 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01644 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01644 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01644 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01644 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
P01644 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01644 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01644 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01644 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01644 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01644 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01644 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01644 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01644 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01644 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01644 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01644 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01644 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01644 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01644 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01644 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
P01644 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01644 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms