Protein–RNA interactions for Protein: O88824

Jtb, Protein JTB, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JtbO88824 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
JtbO88824 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
JtbO88824 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
JtbO88824 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
JtbO88824 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
JtbO88824 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
JtbO88824 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
JtbO88824 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
JtbO88824 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
JtbO88824 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
JtbO88824 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
JtbO88824 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
JtbO88824 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
JtbO88824 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
JtbO88824 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
JtbO88824 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
JtbO88824 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
JtbO88824 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
JtbO88824 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
JtbO88824 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
JtbO88824 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
JtbO88824 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
JtbO88824 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
JtbO88824 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
JtbO88824 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
JtbO88824 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
JtbO88824 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
JtbO88824 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
JtbO88824 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
JtbO88824 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
JtbO88824 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
JtbO88824 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
JtbO88824 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
JtbO88824 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
JtbO88824 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
JtbO88824 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
JtbO88824 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
JtbO88824 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
JtbO88824 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
JtbO88824 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
JtbO88824 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
JtbO88824 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
JtbO88824 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
JtbO88824 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
JtbO88824 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
JtbO88824 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
JtbO88824 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
JtbO88824 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
JtbO88824 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
JtbO88824 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
JtbO88824 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
JtbO88824 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
JtbO88824 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
JtbO88824 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
JtbO88824 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
JtbO88824 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
JtbO88824 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
JtbO88824 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
JtbO88824 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
JtbO88824 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
JtbO88824 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
JtbO88824 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
JtbO88824 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
JtbO88824 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
JtbO88824 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
JtbO88824 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
JtbO88824 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
JtbO88824 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
JtbO88824 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
JtbO88824 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
JtbO88824 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
JtbO88824 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
JtbO88824 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
JtbO88824 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
JtbO88824 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
JtbO88824 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
JtbO88824 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
JtbO88824 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
JtbO88824 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
JtbO88824 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
JtbO88824 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
JtbO88824 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
JtbO88824 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
JtbO88824 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
JtbO88824 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
JtbO88824 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
JtbO88824 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
JtbO88824 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
JtbO88824 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
JtbO88824 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
JtbO88824 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
JtbO88824 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
JtbO88824 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
JtbO88824 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
JtbO88824 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
JtbO88824 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
JtbO88824 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
JtbO88824 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
JtbO88824 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
JtbO88824 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms