Protein–RNA interactions for Protein: O88574

Sap30, Histone deacetylase complex subunit SAP30, mousemouse

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Length 220 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sap30O88574 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sap30O88574 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sap30O88574 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sap30O88574 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sap30O88574 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sap30O88574 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sap30O88574 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sap30O88574 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sap30O88574 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sap30O88574 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sap30O88574 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sap30O88574 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sap30O88574 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sap30O88574 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sap30O88574 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sap30O88574 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sap30O88574 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sap30O88574 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sap30O88574 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sap30O88574 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Sap30O88574 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sap30O88574 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sap30O88574 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sap30O88574 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sap30O88574 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sap30O88574 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sap30O88574 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sap30O88574 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sap30O88574 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Sap30O88574 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sap30O88574 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Sap30O88574 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Sap30O88574 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Sap30O88574 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sap30O88574 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sap30O88574 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sap30O88574 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sap30O88574 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sap30O88574 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sap30O88574 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sap30O88574 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sap30O88574 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Sap30O88574 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sap30O88574 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sap30O88574 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sap30O88574 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sap30O88574 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sap30O88574 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sap30O88574 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sap30O88574 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sap30O88574 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Sap30O88574 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Sap30O88574 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sap30O88574 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sap30O88574 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sap30O88574 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sap30O88574 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sap30O88574 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Sap30O88574 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sap30O88574 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sap30O88574 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sap30O88574 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Sap30O88574 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sap30O88574 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sap30O88574 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sap30O88574 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sap30O88574 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sap30O88574 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sap30O88574 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sap30O88574 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sap30O88574 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sap30O88574 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sap30O88574 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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