Protein–RNA interactions for Protein: O88545

Cops6, COP9 signalosome complex subunit 6, mousemouse

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Length 324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops6O88545 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cops6O88545 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cops6O88545 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cops6O88545 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cops6O88545 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cops6O88545 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cops6O88545 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cops6O88545 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cops6O88545 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cops6O88545 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cops6O88545 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cops6O88545 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cops6O88545 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cops6O88545 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Cops6O88545 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cops6O88545 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cops6O88545 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cops6O88545 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cops6O88545 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cops6O88545 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cops6O88545 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cops6O88545 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cops6O88545 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cops6O88545 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cops6O88545 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cops6O88545 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cops6O88545 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cops6O88545 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cops6O88545 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cops6O88545 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cops6O88545 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cops6O88545 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cops6O88545 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cops6O88545 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cops6O88545 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cops6O88545 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cops6O88545 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cops6O88545 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cops6O88545 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cops6O88545 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cops6O88545 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cops6O88545 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cops6O88545 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cops6O88545 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cops6O88545 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cops6O88545 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cops6O88545 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cops6O88545 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cops6O88545 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cops6O88545 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cops6O88545 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cops6O88545 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cops6O88545 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cops6O88545 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cops6O88545 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cops6O88545 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cops6O88545 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cops6O88545 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cops6O88545 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cops6O88545 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cops6O88545 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cops6O88545 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cops6O88545 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cops6O88545 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cops6O88545 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cops6O88545 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cops6O88545 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cops6O88545 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cops6O88545 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cops6O88545 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cops6O88545 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cops6O88545 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cops6O88545 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cops6O88545 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cops6O88545 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cops6O88545 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cops6O88545 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cops6O88545 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cops6O88545 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cops6O88545 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cops6O88545 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cops6O88545 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cops6O88545 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cops6O88545 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cops6O88545 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cops6O88545 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cops6O88545 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cops6O88545 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cops6O88545 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cops6O88545 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cops6O88545 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cops6O88545 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cops6O88545 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cops6O88545 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cops6O88545 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cops6O88545 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cops6O88545 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cops6O88545 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cops6O88545 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cops6O88545 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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