Protein–RNA interactions for Protein: O88520

Shoc2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shoc2O88520 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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