Protein–RNA interactions for Protein: O88509

Dnmt3b, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3bO88509 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Dnmt3bO88509 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Dnmt3bO88509 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Dnmt3bO88509 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Dnmt3bO88509 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Dnmt3bO88509 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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