Protein–RNA interactions for Protein: O88507

Cntfr, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, mousemouse

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfrO88507 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC12.15□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CntfrO88507 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CntfrO88507 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CntfrO88507 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CntfrO88507 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CntfrO88507 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CntfrO88507 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CntfrO88507 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CntfrO88507 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
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CntfrO88507 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CntfrO88507 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
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CntfrO88507 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CntfrO88507 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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