Protein–RNA interactions for Protein: O88445

Aurkc, Aurora kinase C, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkcO88445 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AurkcO88445 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AurkcO88445 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
AurkcO88445 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
AurkcO88445 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AurkcO88445 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
AurkcO88445 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
AurkcO88445 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
AurkcO88445 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AurkcO88445 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
AurkcO88445 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AurkcO88445 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AurkcO88445 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AurkcO88445 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AurkcO88445 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AurkcO88445 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AurkcO88445 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
AurkcO88445 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AurkcO88445 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
AurkcO88445 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
AurkcO88445 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
AurkcO88445 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AurkcO88445 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AurkcO88445 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
AurkcO88445 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AurkcO88445 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
AurkcO88445 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AurkcO88445 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
AurkcO88445 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AurkcO88445 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AurkcO88445 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
AurkcO88445 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AurkcO88445 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AurkcO88445 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AurkcO88445 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
AurkcO88445 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
AurkcO88445 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
AurkcO88445 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
AurkcO88445 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AurkcO88445 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AurkcO88445 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AurkcO88445 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AurkcO88445 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
AurkcO88445 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
AurkcO88445 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AurkcO88445 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AurkcO88445 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AurkcO88445 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AurkcO88445 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
AurkcO88445 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AurkcO88445 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AurkcO88445 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AurkcO88445 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AurkcO88445 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AurkcO88445 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AurkcO88445 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AurkcO88445 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AurkcO88445 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AurkcO88445 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AurkcO88445 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
AurkcO88445 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
AurkcO88445 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
AurkcO88445 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
AurkcO88445 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AurkcO88445 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AurkcO88445 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AurkcO88445 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AurkcO88445 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AurkcO88445 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AurkcO88445 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
AurkcO88445 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
AurkcO88445 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
AurkcO88445 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AurkcO88445 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
AurkcO88445 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
AurkcO88445 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
AurkcO88445 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
AurkcO88445 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
AurkcO88445 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
AurkcO88445 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
AurkcO88445 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
AurkcO88445 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
AurkcO88445 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
AurkcO88445 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
AurkcO88445 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms