Protein–RNA interactions for Protein: O88255

Gm10509, Mszf57 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10509O88255 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.5 ms