Protein–RNA interactions for Protein: O70370

Ctss, Cathepsin S, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtssO70370 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CtssO70370 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CtssO70370 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CtssO70370 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CtssO70370 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CtssO70370 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CtssO70370 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CtssO70370 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CtssO70370 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtssO70370 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtssO70370 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtssO70370 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtssO70370 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CtssO70370 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtssO70370 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CtssO70370 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtssO70370 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtssO70370 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtssO70370 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtssO70370 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CtssO70370 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CtssO70370 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CtssO70370 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CtssO70370 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CtssO70370 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
CtssO70370 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CtssO70370 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CtssO70370 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CtssO70370 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CtssO70370 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CtssO70370 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CtssO70370 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CtssO70370 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CtssO70370 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CtssO70370 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CtssO70370 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CtssO70370 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CtssO70370 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CtssO70370 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CtssO70370 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CtssO70370 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CtssO70370 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CtssO70370 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CtssO70370 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CtssO70370 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtssO70370 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtssO70370 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtssO70370 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtssO70370 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtssO70370 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtssO70370 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtssO70370 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CtssO70370 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CtssO70370 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtssO70370 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtssO70370 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CtssO70370 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CtssO70370 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CtssO70370 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CtssO70370 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtssO70370 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtssO70370 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CtssO70370 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtssO70370 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CtssO70370 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CtssO70370 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CtssO70370 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtssO70370 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtssO70370 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtssO70370 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtssO70370 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtssO70370 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtssO70370 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtssO70370 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CtssO70370 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtssO70370 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtssO70370 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CtssO70370 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtssO70370 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtssO70370 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtssO70370 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CtssO70370 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtssO70370 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtssO70370 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtssO70370 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtssO70370 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtssO70370 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtssO70370 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CtssO70370 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CtssO70370 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CtssO70370 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CtssO70370 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CtssO70370 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtssO70370 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtssO70370 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtssO70370 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtssO70370 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtssO70370 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtssO70370 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtssO70370 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms