Protein–RNA interactions for Protein: O70157

Top3a, DNA topoisomerase 3-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Top3aO70157 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Top3aO70157 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Top3aO70157 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Top3aO70157 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Top3aO70157 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Top3aO70157 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Top3aO70157 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Top3aO70157 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Top3aO70157 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Top3aO70157 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Top3aO70157 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Top3aO70157 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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