Protein–RNA interactions for Protein: O55112

Aff2, AF4/FMR2 family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Aff2O55112 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Aff2O55112 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Aff2O55112 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Aff2O55112 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Aff2O55112 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Aff2O55112 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Aff2O55112 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Aff2O55112 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Aff2O55112 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Aff2O55112 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Aff2O55112 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Aff2O55112 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Aff2O55112 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Aff2O55112 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Aff2O55112 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Aff2O55112 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Aff2O55112 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Aff2O55112 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Aff2O55112 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Aff2O55112 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Aff2O55112 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Aff2O55112 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Aff2O55112 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Aff2O55112 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Aff2O55112 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Aff2O55112 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Aff2O55112 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Aff2O55112 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Aff2O55112 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Aff2O55112 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Aff2O55112 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Aff2O55112 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Aff2O55112 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Aff2O55112 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Aff2O55112 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Aff2O55112 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Aff2O55112 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Aff2O55112 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Aff2O55112 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Aff2O55112 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Aff2O55112 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Aff2O55112 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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