Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SlkO54988 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SlkO54988 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SlkO54988 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SlkO54988 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SlkO54988 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SlkO54988 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SlkO54988 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SlkO54988 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SlkO54988 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SlkO54988 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SlkO54988 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SlkO54988 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SlkO54988 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SlkO54988 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SlkO54988 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SlkO54988 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SlkO54988 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SlkO54988 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SlkO54988 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SlkO54988 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SlkO54988 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SlkO54988 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SlkO54988 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SlkO54988 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SlkO54988 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SlkO54988 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SlkO54988 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SlkO54988 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SlkO54988 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SlkO54988 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SlkO54988 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SlkO54988 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SlkO54988 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SlkO54988 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SlkO54988 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SlkO54988 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SlkO54988 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SlkO54988 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SlkO54988 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
SlkO54988 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SlkO54988 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SlkO54988 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SlkO54988 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SlkO54988 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SlkO54988 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SlkO54988 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SlkO54988 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SlkO54988 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SlkO54988 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SlkO54988 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SlkO54988 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SlkO54988 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SlkO54988 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SlkO54988 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SlkO54988 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SlkO54988 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SlkO54988 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SlkO54988 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SlkO54988 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SlkO54988 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SlkO54988 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SlkO54988 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SlkO54988 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SlkO54988 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SlkO54988 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SlkO54988 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SlkO54988 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SlkO54988 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SlkO54988 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SlkO54988 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SlkO54988 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SlkO54988 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SlkO54988 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SlkO54988 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SlkO54988 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SlkO54988 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SlkO54988 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SlkO54988 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SlkO54988 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SlkO54988 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SlkO54988 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SlkO54988 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SlkO54988 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SlkO54988 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SlkO54988 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SlkO54988 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SlkO54988 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SlkO54988 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SlkO54988 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SlkO54988 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SlkO54988 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SlkO54988 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SlkO54988 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SlkO54988 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SlkO54988 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SlkO54988 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SlkO54988 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SlkO54988 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SlkO54988 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms