Protein–RNA interactions for Protein: O54949

Nlk, Serine/threonine-protein kinase NLK, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NlkO54949 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NlkO54949 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NlkO54949 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NlkO54949 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NlkO54949 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NlkO54949 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NlkO54949 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NlkO54949 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NlkO54949 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NlkO54949 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NlkO54949 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NlkO54949 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NlkO54949 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NlkO54949 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
NlkO54949 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NlkO54949 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
NlkO54949 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NlkO54949 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NlkO54949 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NlkO54949 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NlkO54949 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NlkO54949 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NlkO54949 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NlkO54949 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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NlkO54949 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NlkO54949 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NlkO54949 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NlkO54949 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NlkO54949 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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NlkO54949 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NlkO54949 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
NlkO54949 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
NlkO54949 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
NlkO54949 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
NlkO54949 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NlkO54949 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NlkO54949 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
NlkO54949 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NlkO54949 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NlkO54949 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NlkO54949 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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NlkO54949 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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NlkO54949 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NlkO54949 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NlkO54949 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NlkO54949 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NlkO54949 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NlkO54949 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NlkO54949 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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NlkO54949 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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NlkO54949 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NlkO54949 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NlkO54949 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NlkO54949 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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NlkO54949 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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NlkO54949 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NlkO54949 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NlkO54949 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NlkO54949 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NlkO54949 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NlkO54949 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NlkO54949 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NlkO54949 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NlkO54949 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NlkO54949 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NlkO54949 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NlkO54949 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NlkO54949 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NlkO54949 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NlkO54949 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NlkO54949 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NlkO54949 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NlkO54949 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NlkO54949 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NlkO54949 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NlkO54949 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NlkO54949 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NlkO54949 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NlkO54949 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NlkO54949 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NlkO54949 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NlkO54949 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NlkO54949 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NlkO54949 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
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