Protein–RNA interactions for Protein: O54890

Itgb3, Integrin beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3O54890 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms