Protein–RNA interactions for Protein: O54828

Rgs9, Regulator of G-protein signaling 9, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rgs9O54828 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rgs9O54828 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rgs9O54828 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rgs9O54828 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rgs9O54828 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rgs9O54828 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rgs9O54828 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rgs9O54828 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rgs9O54828 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rgs9O54828 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rgs9O54828 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rgs9O54828 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rgs9O54828 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rgs9O54828 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rgs9O54828 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rgs9O54828 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rgs9O54828 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rgs9O54828 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rgs9O54828 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rgs9O54828 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rgs9O54828 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rgs9O54828 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rgs9O54828 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rgs9O54828 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rgs9O54828 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rgs9O54828 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rgs9O54828 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rgs9O54828 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rgs9O54828 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rgs9O54828 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rgs9O54828 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rgs9O54828 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rgs9O54828 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rgs9O54828 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rgs9O54828 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rgs9O54828 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rgs9O54828 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rgs9O54828 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rgs9O54828 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rgs9O54828 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rgs9O54828 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rgs9O54828 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rgs9O54828 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rgs9O54828 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rgs9O54828 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rgs9O54828 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rgs9O54828 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rgs9O54828 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rgs9O54828 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rgs9O54828 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rgs9O54828 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rgs9O54828 Gm32390-201ENSMUST00000212713 1172 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rgs9O54828 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rgs9O54828 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rgs9O54828 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rgs9O54828 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rgs9O54828 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rgs9O54828 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rgs9O54828 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rgs9O54828 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rgs9O54828 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rgs9O54828 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rgs9O54828 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rgs9O54828 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rgs9O54828 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rgs9O54828 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rgs9O54828 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rgs9O54828 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rgs9O54828 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rgs9O54828 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rgs9O54828 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rgs9O54828 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rgs9O54828 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rgs9O54828 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rgs9O54828 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rgs9O54828 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rgs9O54828 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rgs9O54828 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rgs9O54828 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rgs9O54828 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rgs9O54828 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rgs9O54828 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rgs9O54828 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rgs9O54828 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rgs9O54828 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rgs9O54828 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rgs9O54828 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rgs9O54828 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rgs9O54828 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rgs9O54828 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rgs9O54828 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rgs9O54828 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rgs9O54828 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rgs9O54828 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rgs9O54828 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rgs9O54828 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rgs9O54828 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rgs9O54828 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rgs9O54828 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rgs9O54828 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms