Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
FxnO35943 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
FxnO35943 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
FxnO35943 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
FxnO35943 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
FxnO35943 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
FxnO35943 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
FxnO35943 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
FxnO35943 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
FxnO35943 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
FxnO35943 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
FxnO35943 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
FxnO35943 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
FxnO35943 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
FxnO35943 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
FxnO35943 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
FxnO35943 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
FxnO35943 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
FxnO35943 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
FxnO35943 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
FxnO35943 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
FxnO35943 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
FxnO35943 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
FxnO35943 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
FxnO35943 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
FxnO35943 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
FxnO35943 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
FxnO35943 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
FxnO35943 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
FxnO35943 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
FxnO35943 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
FxnO35943 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
FxnO35943 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
FxnO35943 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
FxnO35943 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
FxnO35943 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
FxnO35943 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
FxnO35943 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
FxnO35943 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
FxnO35943 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
FxnO35943 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
FxnO35943 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
FxnO35943 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
FxnO35943 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
FxnO35943 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
FxnO35943 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
FxnO35943 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
FxnO35943 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FxnO35943 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FxnO35943 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FxnO35943 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
FxnO35943 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
FxnO35943 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FxnO35943 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FxnO35943 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
FxnO35943 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FxnO35943 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FxnO35943 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FxnO35943 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FxnO35943 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FxnO35943 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC14□□□□□ -0.17
FxnO35943 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FxnO35943 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FxnO35943 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FxnO35943 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FxnO35943 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14□□□□□ -0.17
FxnO35943 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
FxnO35943 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC14□□□□□ -0.17
FxnO35943 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC14□□□□□ -0.17
FxnO35943 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC14□□□□□ -0.17
FxnO35943 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FxnO35943 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FxnO35943 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
FxnO35943 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FxnO35943 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FxnO35943 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FxnO35943 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
FxnO35943 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FxnO35943 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FxnO35943 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
FxnO35943 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FxnO35943 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FxnO35943 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FxnO35943 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FxnO35943 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FxnO35943 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FxnO35943 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FxnO35943 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FxnO35943 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FxnO35943 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FxnO35943 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FxnO35943 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FxnO35943 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FxnO35943 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FxnO35943 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FxnO35943 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FxnO35943 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FxnO35943 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FxnO35943 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FxnO35943 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms