Protein–RNA interactions for Protein: O35904

Pik3cd, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3cdO35904 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pik3cdO35904 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pik3cdO35904 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms