Protein–RNA interactions for Protein: O35887

Calu, Calumenin, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CaluO35887 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CaluO35887 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CaluO35887 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CaluO35887 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CaluO35887 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CaluO35887 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CaluO35887 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CaluO35887 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CaluO35887 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CaluO35887 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CaluO35887 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CaluO35887 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CaluO35887 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CaluO35887 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CaluO35887 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CaluO35887 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
CaluO35887 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CaluO35887 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CaluO35887 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CaluO35887 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CaluO35887 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CaluO35887 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CaluO35887 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CaluO35887 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CaluO35887 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CaluO35887 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CaluO35887 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CaluO35887 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CaluO35887 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CaluO35887 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CaluO35887 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CaluO35887 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CaluO35887 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CaluO35887 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CaluO35887 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CaluO35887 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CaluO35887 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CaluO35887 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CaluO35887 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CaluO35887 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CaluO35887 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CaluO35887 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CaluO35887 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CaluO35887 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CaluO35887 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CaluO35887 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CaluO35887 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CaluO35887 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CaluO35887 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CaluO35887 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CaluO35887 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CaluO35887 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CaluO35887 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CaluO35887 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CaluO35887 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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CaluO35887 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CaluO35887 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CaluO35887 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CaluO35887 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CaluO35887 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CaluO35887 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CaluO35887 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CaluO35887 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CaluO35887 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CaluO35887 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CaluO35887 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CaluO35887 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CaluO35887 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CaluO35887 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CaluO35887 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CaluO35887 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CaluO35887 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CaluO35887 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CaluO35887 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CaluO35887 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CaluO35887 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CaluO35887 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CaluO35887 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CaluO35887 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CaluO35887 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CaluO35887 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CaluO35887 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CaluO35887 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CaluO35887 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CaluO35887 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CaluO35887 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CaluO35887 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CaluO35887 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CaluO35887 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CaluO35887 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CaluO35887 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CaluO35887 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CaluO35887 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CaluO35887 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CaluO35887 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CaluO35887 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CaluO35887 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CaluO35887 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CaluO35887 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms